Тривалість лікування амітриптилін зазвичай становить кілька місяців. Можливі короткі курси (по 10-14 днів) або одноразовий прийом (при реактивних станах). При хронічно протікаючих захворюваннях можливий багаторічний та довічний прийом.
Початкова добова доза прийому внутрішньо становить 50-75 мг (25 мг в 2-3 прийоми), потім дозу поступово збільшують на 25-50 мг, до отримання бажаного антидепресивного ефекту. Оптимальна добова доза становить 150-200 мг (максимальна частина дози приймається на ніч).
Препарат слід скасовувати поступово, щоб уникнути розвитку синдрому відміни, таких як головний біль, порушення сну, дратівливість і загальне погане самопочуття. Ці симптоми є ознакою залежності від препарату.
Призначають внутрішньо, не розжовуючи, відразу після їди (для зменшення подразнення слизової оболонки шлунка). Дорослим при депресії початкова доза – 25-50 мг на ніч, потім поступово доза може бути збільшена з урахуванням ефективності та переносимості препарату до максимальної 300 мг на добу.